传说当世界陷入黑暗的危难之际，拥有神奇力量的光之美少女便会出现人间，打败黑暗邪恶的敌人，拯救世界。不久之前，十几位光之美少女现身横滨，解除了人类的危机。某中学转学生坂上步（能登麻美子 配音）是一个内向害羞的女孩，虽然和同学们都是光之美少女的崇拜者，无奈却无法鼓起勇气和同学们交流。在放学回家的路上，苦恼的小步突然看见一个神秘而可爱的黄色生物。她为之取名小呼（熊田圣亚 配音），并与之成为了好朋友，殊不知这正是被光之美少女打败的怪物的碎片变化而成。与此同时，光之美少女们则在城市各个角落寻找碎片的踪迹。
未完待续的大战即将展开，光之美少女能否再次拯救美丽的城市……